El presidente Gustavo Petro encendió las alarmas el domingo 21 de junio tras denunciar que su hijo Andrés, quien vive en el exterior, fue víctima de suplantación de identidad al momento de votar. A través de redes sociales, el mandatario reportó que cuando su hijo se acercó a la mesa de votación, descubrió que "ya había una señora votado por él". Aunque finalmente se le permitió ejercer su derecho al voto, Petro advirtió que el cónsul le confirmó que estas irregularidades eran frecuentes y no sucedían con tanta intensidad anteriormente. El incidente llevó al presidente a reclamar mayor vigilancia de testigos en los puestos de votación internacionales.

La Registraduría Nacional respondió con rapidez a los señalamientos presidenciales. El órgano electoral fue claro al aclarar que los jurados en el exterior son designados directamente por los consulados de Colombia, no por su entidad. Con esto, la Registraduría se deslindó de responsabilidad directa sobre lo ocurrido en las mesas internacionales durante esa jornada electoral.

Pero la controversia fue más allá del caso puntual del hijo del presidente. Petro también cuestionó la seguridad tecnológica del sistema, específicamente los formularios E-14, argumentando que faltaban mecanismos de protección como la "estampilla de tiempo" y el "candado hash" en las bases de datos. Según el mandatario, estas ausencias permitirían que alguien alterara los resultados. Petro insistió en que el registrador no había respondido favorablemente a su solicitud de restaurar esos sistemas de seguridad.

La Registraduría no se quedó callada ante estas críticas técnicas. En un comunicado emitido el mismo 21 de junio, la entidad desmintió categóricamente los señalamientos de Petro. Explicó que ambos mecanismos de seguridad permanecen activos dentro de los procesos de control electoral. La Registraduría precisó que las marcas de tiempo están registradas en los metadatos y en las bitácoras internas del sistema, información que está disponible para que campañas, entes de control y auditores puedan verificarla.