La jornada electoral del domingo 31 de mayo se vio marcada por varios reportes de irregularidades en diferentes puntos del territorio nacional, según denuncias que llegaron durante la mañana de votación. Los hechos documentados apuntaban a intentos deliberados por alterar el desarrollo normal de la contienda electoral.

Uno de los episodios que generó mayor controversia durante la mañana fue la participación del presidente Petro y del ministro del Interior Armando Benedetti al momento de emitir su voto. Varios sectores cuestionaron públicamente esta acción, argumentando que funcionarios en sus posiciones no deberían participar activamente en política de esta manera.

En materia de delitos electorales se registraron capturas significativas. En las ciudades de Popayán y Cali fueron detenidas 4 personas por este tipo de infracciones. De manera paralela, en Cundinamarca las autoridades capturaron a un hombre de 18 años quien portaba 110 millones de pesos en efectivo, un hallazgo que sugiere movimientos de dinero irregulares relacionados con la jornada electoral.