Germán Vargas Lleras pasó buena parte de su carrera política esquivando la muerte. En su libro "Cuentas Claras" relató que fueron diez los momentos en que su vida estuvo en peligro, pero logró salir adelante en cada ocasión. Sin embargo, dos de esos sucesos marcaron profundamente su trayectoria: atentados con artefactos explosivos que lo dejaron herido pero no lo apartaron del Senado.

El primero ocurrió el 11 de diciembre de 2002. Vargas Lleras abría su correspondencia en el despacho cuando decidió destomar un sobre entre los regalos navideños que había recibido. El paquete estalló en sus manos. La explosión fue seria: tuvo que ser atendido de urgencia, sus brazos quedaron enyesados y perdió tres dedos de la mano derecha. Casi tres años después, el 10 de octubre de 2005, otro atentado lo acechaba. Esta vez fue una bomba que explotó cerca de donde se movilizaba el entonces senador, que era conocido por sus críticas directas contra las guerrillas. El carro en el que viajaba resultó afectado y hasta sus guardaespaldas sufrieron heridas.

Con la firma del acuerdo de paz entre el gobierno y las Farc el 24 de noviembre de 2016, llegó la Jurisdicción Especial para la Paz y la posibilidad de que los responsables confesaran sus actos. Rodrigo Londoño Echeverri, Timochenko, quien llegó al Congreso como parte de los integrantes de la guerrilla desmovilizada, decidió asumir responsabilidades. En una carta dirigida a Juan Manuel Santos, reconoció de manera explícita: "Asimismo reconoceremos ante las instancias de verdad, los dos atentados que las FARC-EP planearon y ejecutaron contra su Vicepresidente Germán Vargas Lleras, a quien también le pediremos perdón con humildad".

La respuesta de Vargas Lleras fue noble. Dijo: "A diferencia de los que sí murieron y hoy no pueden contestar, en mi caso personal acepto el perdón que se me ofrece. Ni siquiera reclamo un acto simbólico para el efecto. Me basta con conocer toda la verdad". Aun así, pidió que se esclarecieran completamente los hechos con "pruebas fehacientes" que identificaran a los autores intelectuales.

Pasaron cuatro años más hasta que el reconocimiento oficial llegó. El 16 de mayo de 2024, la sala de Reconocimiento de Verdad de la JEP lo acreditó como víctima directa por los crímenes no amnistiables cometidos por las extintas Farc-EP. El comunicado fue claro en reconocer su condición de "exvicepresidente de la República, exsenador y exministro" en el marco de la investigación de esos delitos durante el conflicto armado colombiano.