Juan Fernando Cristo tomó una decisión diferente a la de su candidato. El exministro del Interior y líder del partido En Marcha reconoció a Abelardo de la Espriella como presidente electo tan pronto como los escrutinios municipales confirmaron los resultados del preconteo, mientras que Iván Cepeda prefería esperar los datos definitivos. La diferencia fue cerrada: De la Espriella se llevó 12.959.542 votos (49.66%), superando por poco los 12.708.712 (48.7%) que obtuvo Cepeda, quien representaba la continuidad del gobierno Petro.

Cristo fundamentó su reconocimiento en los números que la Registraduría reportó el martes 23 de junio: los escrutinios en los municipios coincidieron en un 99.997% con el preconteo, lo que para él era suficiente certeza. "Los escrutinios concluyeron y sus resultados confirman el triunfo por un estrecho margen de Abelardo de la Espriella. Se rompieron todos los récords de participación ciudadana", escribió, refiriéndose a esa participación inédita superior al 63% en una elección presidencial.

Al felicitar al presidente electo, Cristo no dejó pasar la oportunidad de reconocer el peso que tuvo su candidato en los resultados. "Los colombianos decidieron en democracia, con libertad y tranquilidad. Felicitaciones al presidente electo por su elección. Poco menos de la mitad de los colombianos escogió la opción de la vida y la paz de nuestro candidato Iván Cepeda Castro", expresó, manteniendo viva la bandera de su movimiento pese a la derrota.

Pero Cristo no se quedó en los resultados electorales. Lanzó un mensaje sobre lo que viene: "El gran desafío ahora es superar una división profunda del país que nos impide enfrentar con éxito los grandes desafíos en salud, seguridad, energía y servicios públicos". Allí rescató la propuesta que Cepeda planteó durante su discurso de la noche electoral: el Acuerdo Nacional. "El Acuerdo Nacional es necesario como lo ha planteado nuestro candidato de la Alianza por la Vida y lo reiteró la noche del domingo. Por el bien de nuestro país le deseo éxitos al nuevo jefe de estado en su gestión", dijo.

Cristo fue pieza clave en la campaña de Cepeda. Exministro del Interior bajo tanto Gustavo Petro como Juan Manuel Santos, llegó a la candidatura del Pacto Histórico tras renunciar a su propia precandidatura. Desde el inicio insistió en que Cepeda abandonara la idea de una Asamblea Nacional Constituyente, una propuesta que en primera vuelta no se concretó. Solo después de la derrota inicial de De la Espriella y ante la presión de sectores de centro encabezados por Claudia López, Cepeda dejó ese objetivo de lado para la segunda vuelta.

Su trabajo fue fundamental para tejer alianzas con sectores liberales y con la Alianza Verde, partido con el que En Marcha compartió lista al Senado en marzo. Fue así como se formó la "Alianza por la Vida" que respaldó a Cepeda. Cristo confía en que la institucionalidad aguante la turbulencia: "El sistema de pesos y contrapesos diseñado en la constitución del 91 funciona y seguirá garantizando la separación de poderes y nuestra estabilidad institucional".